Курс лекций по общей микробиологии и основам вирусологии. В 2 ч. Часть 1
Включены основные сведения о прокариотных микроорганизмах и неклеточных формах живых организмов, их строении, физиологии, особенностях генетической системы, способах передачи генетической информации, экологии, роли микроорганизмов в круговороте веществ и значении микробиологических процессов в биотехнологии. Предназначен для студентов специальностей "Почвоведение" (020701), "Биология" (020201), "Экология" (020801), "Охрана окружающей среды и рациональное использование природных ресурсов" (280201).
клетке; включают три компонента: спиральную жгутиковую нить постоян- ной толщины, крючок и базальное тельце. Крючок, к которому присоеди- нена жгутиковая нить, имеет длину 30 - 45 нм и состоит из отличающегося от флагеллина белка. Он соединен с базальным тельцем, которое располагается целиком в оболочке (в клеточной стенке и цитоплазматической мембране). Базальное тельце состоит из цен- трального стержня, заключенного в систему особых колец. У грамотрица-тельных бактерий их две пары: внешняя (кольца L и P) и внутренняя (S и M). Кольца L и P (рис. 3) расположены внутри клеточной стенки (кольцо L -в липополисахариде (ЛПС), а кольцо P -в слое пептидогликана). Они исполняют роль втулки стержня. Внутренняя пара (S и M) фиксирована на цитоплазматической мембране, причем Рис. 3. Строение жгутика грамот- кольцо S располагается в рицательных бактерий: 1 - нить; 2 - периплазматическом пространстве, а M - крючок; 3 - базальное тельце; 4 - на цитоплазматической мембране или в стержень; 5 - L-кольцо; 6 - P- кольцо; 7 - S-кольцо; 8 - M-кольцо; 9 ней. - цитоплазматическая мембрана; 10 Жгутики у грамположительных периплазматическое пространство; бактерий, имеющих более толстую и 11 пептидоглика-новый слой; 12 - гомогенную клеточную стенку, содержат наружная мембрана (по De только одну пару колец - S и M. Эти Pamphilis, Adler, 1971 г.) [8] кольца обеспечивают вращательное движение жгутиков. Благодаря этому вращению происходит направленное движение бактерий. Жгутиковый аппарат обладает особым бинарным пе- реключателем, который позволяет менять направление движения жгутиков против часовой стрелки на движение по часовой стрелке. Со жгутиковым аппаратом связана также и хемотаксическая активность бактерий. Генети- ческий контроль синтеза жгутиковых белков, их сборки и активности осу- ществляется особым опероном. Установлено, что мутации в области mot- генов (от англ. motility - подвижность) приводят к потере только подвиж- ности, однако все структуры жгутиков сохраняются; мутации в che-генах (от греч. chemotaxis - хемоподвижность) - к потере хемотаксической ак- тивности при сохранении структуры жгутиков и их подвижности. 31 Бактериальные жгутики движутся за счет протонной силы (хемиос- мотического потенциала) бактериальной мембраны, а не гидролиза ATФ. Прокариоты обладают разными типами движения (поведения), то есть спо- собностью двигаться в ответ на воздействия окружающей среды. Напри- мер, в процессе хемотаксиса бактерия может ощущать качество и количе- ство некоторых химических веществ в окружающей среде и двигаться к ним (если это полезные питательные вещества) или удаляться от них (если это вредные вещества). Фимбрии или реснички (от лат. fimbria - бахрома) - нитевидные об- разования, более тонкие и короткие (3 - 20 нм х 0,3 - 10 мкм), чем жгутики (цв. Аклейка, рис. II). Фимбрии отходят от поверхности клетки и состоят из белка, называемого пилином. Биологическое значение фимбрий состоит в том, что с их помощью бактерии прикрепляются только к определенным поверхностям. Среди фимбрий разного типа выделяют фимбрии, ответственные за адгезию, то есть прикрепление бактерии к поражаемой клетке (например пили общего типа - common pili); фимбрии, ответственные за питание, водно-солевой обмен; половые (F-пили), или конъюгационные, пили. Пили общего типа многочисленны и достигают количества нескольких сотен в одной клетке. Они являются основными факторами патогенности у болез- нетворных бактерий, потому что бактерии ими прикрепляются к чувстви- тельным клеткам и заселяют их, то есть факторами адгезии и колонизации. Кроме того, они препятствуют фагоцитозу. Термин «пили» применяется чаще в отношении особых фимбрий - половых пилей, образуемых так называемыми мужскими клетками- донорами, содержащими трансмиссивные плазмиды (F, R, Col); их количе- ство 1 - 2 на клетку. Пили (донорные ворсинки) - длинные (0,5 - 10 мкм) нитевидные структуры белковой природы. Они присущи бактериям, имеющим конъю- гативные плазмиды (F- и R-плазмиды). Они, как и жгутики, имеют внут- реннюю полость и построены из особого белка, отличающегося от флагел- лина и пилина. Их синтез находится под контролем плазмидных генов. Они служат аппаратом конъюгации: с их помощью устанавливается непо- средственный контакт между донорной и реципиентной клетками. Донор- ные пили обнаруживают с помощью донорспецифических фагов, которые на них адсорбируются и далее вызывают лизис клетки-хозяина. Донорные пили встречаются в количестве 1 - 2 на клетку. 32 КАПСУЛЫ, СЛИЗИСТЫЕ СЛОИ И ЧЕХЛЫ Некоторые бактерии (пневмококки, клебсиеллы и др.) образуют кап- сулу - слизистое образование, прочно связанное с клеточной стенкой, имеющее четко очерченные внешние границы. Капсула различима в маз- ках-отпечатках из патологического материала, еѐ толщина 0,2 мкм. В чис- тых культурах бактерий капсула образуется реже. В ее образовании участ- вует цитоплазматическая мембрана. По химическому составу различают капсулы, состоящие из полисахаридов, содержащих аминосахара, и капсу- лы полипептидной природы, например у сибиреязвенной бациллы. Выявление капсул осуществляется методом негативного контрасти- рования. Капсула гидрофильна, она препятствует фагоцитозу бактерий. Многие бактерии образуют микрокапсулу - слизистое образование, выявляемое при электронной микроскопии. От капсулы следует отличать слизь — мукоидные экзополисахариды, не имеющие четких внешних гра- ниц. Бактериальные экзополисахариды участвуют в адгезии (прилипании к субстратам), их еще называют гликокаликсом. Кроме того, что бактериальные экзополисахариды синтезируются бактериями путем секреции их компонентов, существует и другой меха- низм их образования - при действии внеклеточных ферментов на дисаха- риды. В результате этого образуются декстраны и леваны. Капсула и слизь предохраняют бактерии от повреждений, высыха- ния, так как они гидрофильны и хорошо связывают воду, препятствуют действию защитных факторов макроорганизма и бактериофагов и могут являться запасом питательных веществ. Чехлы - это более сложные структуры. Обычно они имеют и более сложный химический состав, например, у Sphaerotilus natans чехол содер- жит: сахаров - 36, гексозамина -11, белка - 27, липида - 5,2, фосфора - 0,5 %. Капсулы, слизистые слои и гликокаликс, как известно, определяют специфические свойства поверхности бактериальных клеток, и некоторые компоненты этих структур являются специфическими антигенами. Капсулы также защищают бактерии от хищных простейших и от действия антибактериальных агентов животного (фагоциты, антитела) или растительного (микроцины) происхождения. Капсулы некоторых почвен- ных бактерий защищают их от постоянной угрозы высушивания. 33 КЛЕТОЧНАЯ СТЕНКА Это важный и обязательный структурный элемент большинства про- кариотных клеток, который располагается под капсулой или слизистым чехлом или непосредственно контактирует с окружающей средой. На долю клеточной стенки приходится от 5 до 50 % сухого вещества клетки. Это прочная, упругая структура, служащая механическим барьером между протопластом и внешней средой, придающая клеткам определенную, при- сущую им форму и поддерживающая высокое осмотическое давление в клетке. Концентрация солей в клетке, как правило, намного выше, чем в ок- ружающей среде, и поэтому между ними существует большое различие в осмотическом давлении. Клеточная стенка механически защищает клетку от проникновения в нее избытка воды, то есть сдерживает высокое осмо- тическое давление в клетке. Она участвует в процессе деления клетки и транспорте метаболитов. Клеточная стенка прокариот резко отличается от таковой у эукариот как по строению, так и по химическому составу. Она содержит специфиче- ские полимерные комплексы, которые остутствуют в других структурах клетки. Химический состав и строение клеточной стенки постоянны для определенного вида и являются важным признаком при идентификации. В зависимости от строения клеточной стенки прокариоты, относя- щиеся к бактериям, делятся на две большие группы. В 1884 г. датский уче- ный Х. Грам предложил метод окраски (впоследствии этот метод стали на- зывать «окраска по Граму»), в результате которого бактерии делятся на грамположительные (сине-фиолетовый) и грамотрицательные (красный цвет). Если фиксированные бактерии окрасить сначала кристаллическим фиолетовым, а затем йодом, то образуется окрашенный комплекс (генциа- новый фиолетовый в комплексе с йодом). В зависимости от строения кле- точной стенки при последующей обработке спиртом этот комплекс либо удерживается, либо вымывается. Если бактерии остаются с сине- фиолетовой окраской, то это свидетельствует о том, что обработка окра- шенного по Граму мазка бактерий спиртом вызывает сужение пор в пепти- догликане и тем самым задерживает краску в клеточной стенке. То есть бактерии окрашиваются грамположительно. 34 Наоборот, грамотрицательные бактерии после воздействия спиртом утрачивают краситель, обесцвечиваются и при обработке фуксином окра- шиваются в красный цвет вследствие меньшего содержания пептидоглика- на (1 - 10 % массы клеточной стенки). В состав клеточной стенки бактерий входят семь различных групп химических веществ (табл. 3). Таблица 3 Химический состав клеточных стенок грамположительных и грамотрицательных бактерий (Rose, 1971 г.; Freer, Salton, 1971 г.) Компоненты клеточной Грамположи- Грамотрицательные эубактерии стенки тельные Внутренний Внешний слой эубактерии слой (пепти- (наружная кле- догликановый) точная мембрана) Пептидогликан + + - Тейхоевые кислоты + - - Полисахариды + - + Белки ± - + Липиды ± - + Липополисахариды - - + Липопротеины - ± + Примечание. (+) - присутствуют; (-) - отсутствуют; (±) - не у всех. Клеточные стенки грамположительных и грамотрицательных бакте- рий резко различаются по химическому составу и по ультраструктуре. У грамположительных бактерий клеточная стенка толще (от 20 до 80 нм), чем у грамотрицательных, и пептидогликан (синонимы муреин, мукопептид) составляет основную массу ее вещества (от 40 до 90 %). Под электронным микроскопом она выглядит как гомогенный электронно- плотный слой. Пептидогликан представлен параллельно расположенными молеку- лами гликана, состоящего из остатков N-ацетилглюкозамина и N- ацетилмурамовой кислоты, соединенных гликозидной связью (цв. вклейка, рис. III). Гликановые молекулы связаны поперечной пептидной связью. От- сюда название этого полимера - пептидогликан. Основу пептидной связи составляют тетрапептиды, состоящие из чередующихся L- и D- аминокислот, например L-аланин - D-глутаминовая кислота - мезодиами- 35 нопимелиновая кислота - D-аланин. В пептидогликане грамположитель- ных бактерий вместо мезодиаминопимелиновой кислоты часто содержится L-диаминопимелиновая кислота или лизин. Элементы гликана (ацетилглю- козамин и ацетилмурамовая кислота) и аминокислоты тетрапептида (мезо- диаминопимелиновая и D-глутаминовая кислоты, D-аланин) являются от- личительной особенностью бактерии, поскольку отсутствуют у животных и человека. Пептидогликан ковалентно связан с тейхоевыми кислотами (от греч. teichos - стенка). Это уникальный класс химических соединений, пред- ставляющих собой полимеры, построенные на основе рибита (пятиатомно- го спирта), остатки которого соединены между собой фосфодиэфирными связями. Поскольку это длинные линейные молекулы, они пронизывают весь слой пептидогликана, достигая поверхности клеточной стенки, и яв- ляются основными антигенами грамположительных бактерий. Остающие- ся свободные гидроксилы фосфорной кислоты придают тейхоевой кислоте свойства полианиона, таким образом, они определяют поверхностный за- ряд клетки. Сахарные компоненты тейхоевых кислот входят в состав ре- цепторов для некоторых бактериофагов и определяют возможность ад- сорбции фага на клеточной поверхности. В клеточной стенке грамположительных бактерий содержится не- большое количество полисахаридов, липидов и белков. Входящие в состав клеточной стенки полисахариды, липиды могут ковалентно связываться с ее макромолекулами в отличие от белков, кото- рые формируют на ее внешней поверхности отдельный слой. Таким образом, основными компонентами клеточной стенки грампо- ложительных бактерий являются три типа макромолекул: пептидогликаны, тейхоевые кислоты и полисахариды, которые, ковалентно связываясь, об- разуют сложную структуру с весьма упорядоченной пространственной ор- ганизацией. Строение клеточной стенки у грамотрицательных бактерий на- много сложнее. У них обнаружена многослойная клеточная стенка. В ее состав входит гораздо большее число макромолекул разного химического типа (рис. 4). Пептидогликан образует только внутренний слой клеточной стенки, неплотно прилегая к цитоплазматической мембране. Для разных видов грамотрицательных бактерий его содержание колеблется в широких пределах и существенно меньше ( 5 - 1 0 %), чем у грамположительных 36 бактерий. Химическая структура пептидогликана грамотрицательных бак- терий в основном сходна со структурой пептидогликана грамположитель- ных бактерий. Снаружи от пептидогликана располагается дополнительный слой клеточной стенки - наружная мембрана. Она состоит из фосфолипи- дов, типичных для элементарных мембран, белков, липопротеина и липо- сахарида. О-Спшифическая цепь ЛПС ЯдроЛПС Л Наружная мембрана Литтопротеин Пегггидогликак иттид А Рис. 4. Схема строения клеточной стенки и Цитотигазматическая мембрана цитоплазматической мембраны грамотрицательных бактерий: Л- липид; П- протеин; ЛПС - липополисахарид Специфическим компонентом наружной мембраны является липопо- лисахарид сложного молекулярного строения, занимающий около 30 - 40 % поверхности и локализованный во внешнем слое. Он состоит из трех компонентов: липидаА, базисной части, или ядра, и О-специфической це- пи полисахарида, образованной повторяющимися идентичными олигоса- 37 харидными последовательностями. Липополисахарид закреплен в наруж- ной мембране липидом А, придающим токсичность липополисахариду, отождествляемому поэтому с эндотоксином. От липидаА отходит базисная часть липополисахарида. Наиболее постоянной частью ядра липополиса- харида является кетодезоксиоктоновая кислота. О-специфическая цепь, от- ходящая от ядра липополисахарида, определяет серогруппу, серовар (раз- новидность бактерий, выявляемая с помощью иммунной сыворотки) выде- ленного штамма бактерий. Таким образом, с понятием липополисахарида связаны представления об О-антигене, по которому можно дифференциро- вать бактерии. Помимо типичной клеточной стенки грамотрицательных бактерий, у некоторых представителей этой группы обнаружены дополнительные слои разной электронной плотности, располагающиеся с внешней стороны от наружной мембраны. Но до настоящего времени не ясно, относятся ли они к клеточной стенке, являясь результатом ее последующего усложнения, или же представляют собой структурные элементы многослойного чехла. Атипичные клеточные стенки прокариот. У некоторых скользя- щих бактерий (миксобактерии, флексибактерии), способных в процессе перемещения по твердому субстрату периодически менять форму клеток, например путем изгибания, была обнаружена нетипичная для грамотрица- тельных бактерий эластичная клеточная стенка. Объяснением такой гибко- сти клеточной стенки этих бактерий может быть особенность строения пептидогликанового компонента (низкая сшитость этого компонента кле- точной стенки). У метанобразующих архей клеточные стенки содержат пептидогли- кан особого химического строения. У других представителей этой группы клеточная стенка состоит исключительно из кислого гетерополисахарида; у некоторых экстремально галофильных, метанобразующих и ацидотер- мофильных архей - только из белка. Археи с клеточной стенкой белковой природы не окрашиваются по Граму, остальные типы архей дают грампо- ложительную реакцию. Прокариоты, не имеющие клеточной стенки. Впервые бактерии, не имеющие клеточной стенки, были обнаружены при воздействии на них лизоцимом - ферментом из группы гликозидаз, содержащимся в яичном белке, слюнной жидкости и выделяемом некоторыми бактериями. 38 Бактерии с частично (сферопласты) или полностью (протопласты) утраченной клеточной стенкой можно получать при воздействии опреде- ленными химическими веществами в лабораторных условиях. При нару- шении синтеза клеточной стенки бактерий под влиянием фермента лизо- цима или пенициллина, а также защитных факторов организма образуются клетки с измененной, часто шаровидной, формой (протопласты). После удаления ингибитора синтеза клеточной стенки такие изме- ненные бактерии могут реверсировать, то есть приобретать полноценную клеточную стенку и восстанавливать исходную форму. Бактерии сферопластного или протопластного типа, утратившие спо- собность к синтезу пептидогликана под влиянием антибиотиков или дру- гих факторов, но сохранившие способность к размножению, называются L- формами. L-формы могут возникать и в результате мутаций. Они пред- ставляют собой осмотически чувствительные шаровидные, колбовидные клетки различной величины, в том числе и проходящие через бактериаль- ные фильтры. L-формы могут образовывать многие бактерии - возбудите- ли инфекционных болезней. Функции клеточной стенки прокариот многочисленны, разнооб- разны и очень важны для клетки: - механическая защита клетки от воздействия окружающей среды; - поддержание ее внешней формы; - обеспечение возможности существования в гипотонических растворах; - транспорт веществ; - образование периплазматического пространства у грамотрицатель- ных бактерий, заполненного раствором со специфическими транспортны ми белками и гидролитическими ферментами. У грамположительных бак терий эти ферменты выделяются в окружающую среду, чтобы не происхо дило самопереваривание собственных молекул. ЗНАЧЕНИЕ ПОВЕРХНОСТНЫХ КОМПОНЕНТОВ КЛЕТКИ Все поверхностные компоненты прокариотной клетки имеют боль- шое значение, так как они осуществляют контакт клетки с окружающей средой и позволяют реагировать на внешние воздействия так, чтобы под- держивать собственное существование и выживание в окружающей среде. Их свойства определяются молекулярным составом цитоплазматиче- ской мембраны и клеточной стенки, включая липополисахарид. 39 Наиболее важные функции, которые осуществляют прокариоты, ис- пользуя свои поверхностные компоненты: 1) образуют барьеры проходимости, которые позволяют осуществ лять избирательный проход питательных веществ и исключение вредных веществ; 2) вырабатывают "адгезины", которым свойственно прикрепляться к определенным поверхностям или тканям; 3) выделяют ферменты, чтобы добиться определенных реакций на поверхности клетки, важной для выживания прокариот; 4) выделяют белки, которые могут быть ответом на температуру, ос мотическое давление, соленость, свет, кислород, питательные вещества и т.д., или являться сигналом для генома клетки, который даст правильный ответ на новые воздействия окружающей среды. Область Б - плазматическая мембрана и цитоплазматическая область, которая содержит геном клетки (ДНК) и рибосомы МЕМБРАНЫ Химический состав мембран. Мембраны бактерий структурно по- добны мембранам клетки эукариот, за исключением того, что бактериаль- ные мембраны состоят из насыщенных и мононенасыщенных жирных кислот (редко полиненасыщенных жирных кислот) с 16 - 18 углеродными атомами и обычно не содержат стерины. Содержимое клетки отделяется от клеточной стенки цитоплазмати- ческой мембраной - обязательным структурным элементом любой клетки, нарушение целостности которого приводит к потере клеткой жизнеспо- собности. На долю цитоплазматической мембраны приходится 8 - 15 % сухого вещества клетки. У большинства прокариот цитоплазматическая мембрана является единственной мембраной. В клетках фототрофных и ряда хемотрофных прокариот содержатся также мембранные структуры, располагающиеся в цитоплазме и получившие название внутриплазмати- ческих мембран. Их происхождение и функции будут рассмотрены ниже. Цитоплазматическая мембрана - белково-липидный комплекс, кото- рый составляют 50 - 75 % белков, от 15 до 45 % липидов и небольшое ко- личество углеводов. Липиды и белки составляют 95 % и более вещества мембран. Главным липидным компонентом бактериальных мембран явля- ются фосфолипиды - производные 3-фосфоглицерина. Хотя у прокариот 40